Nuevos kits y novedoso flujo de trabajo para proteómica de plasma y suero por LC

Capacitamos a nuestros clientes en ciencias de la vida para establecer conocimientos biológicos a través de soluciones y flujos de trabajo confiables y eficientes que establecen el estándar para el análisis de proteínas. Nuestro espíritu de equipo, energía y compromiso...

HOUSTON, TX — En ASMS 2023, PreOmics GmbH anuncia el lanzamiento de sus nuevos kits ENRICH-iST™, que permiten el enriquecimiento biológicamente imparcial de proteínas séricas y plasmáticas menos abundantes en partículas paramagnéticas no funcionalizadas, mejorando las profundidades típicas del análisis proteómico del plasma en 50 por ciento a más del 100 por ciento, en comparación con el plasma puro o la proteómica del suero sin agotamiento ni enriquecimiento. El novedoso flujo de trabajo ENRICH-iST permite un procesamiento rápido y sólido de hasta 96 muestras de plasma en paralelo para la investigación y validación traslacional y clínica reproducibles de grandes cohortes. El asequible flujo de trabajo de enriquecimiento de rutina ENRICH-iST complementa muy bien los flujos de trabajo existentes de investigación de descubrimiento de proteómica de plasma ultraprofundo que utilizan el agotamiento automatizado de perlas o el enriquecimiento de matriz de nanopartículas.

La tecnología ENRICH-iST ofrece una solución simple, rápida (<5 h en total) y rentable para el procesamiento proteómico de muestras de plasma o suero de varias especies, incluidos humanos, roedores, NHP, perros y cerdos. Al requerir solo 20 microL de material de partida, ofrece consistentemente resultados mejorados y reproducibles para análisis LC-MS, por ejemplo, mediante espectrometría de masas DIA-PASEF timsTOF 4D Proteomics. Utilizando microesferas paramagnéticas no funcionalizadas, la tecnología permite el enriquecimiento biológicamente imparcial de proteínas menos abundantes y admite plataformas de automatización de manejo de líquidos, como los sistemas Tecan FLUENT.

El Dr. Andreas-David Brunner, Drug Discovery Sciences, Boehringer Ingelheim Pharma GmbH & Co. KG, afirma: "Trabajamos rutinariamente con cohortes de biofluidos recolectados de especies preclínicas. La novedosa tecnología ENRICH de PreOmics nos permitió lograr estudios proteómicos confiables y profundos. datos sin un laborioso desarrollo de métodos. El nuevo kit funcionó de inmediato; el flujo de trabajo es intuitivo y puede automatizarse por completo. Esta solución nos permite estandarizar completamente nuestros procesos y mejora significativamente nuestro rendimiento".

En un estudio de referencia, se procesaron muestras de plasma y suero de humanos, ratones y ratas (de los proveedores Sigma Aldrich, BioIVT y Diaserve Laboratories GmbH) utilizando el novedoso flujo de trabajo ENRICH-iST en comparación con el agotamiento basado en anticuerpos, así como a muestras puras sin procesar. Los péptidos se analizaron en un espectrómetro de masas timsTOF HT (Bruker Daltonics) en modo DIA-PASEF usando un gradiente nanoLC de 30 minutos. Se demostró que el flujo de trabajo ENRICH-iST aumenta la profundidad proteómica de los péptidos y las proteínas entre 1,5 y 2,2 veces en comparación con las muestras puras. Los coeficientes de variación (CV) típicos dentro de las réplicas estaban por debajo del 12 por ciento, lo que enfatiza la alta repetibilidad del flujo de trabajo de ENRICH-iST. La combinación de las proteínas identificadas con la base de datos del proteoma plasmático reveló una cobertura superior para el flujo de trabajo ENRICH-iST sobre las muestras limpias y empobrecidas con proteínas identificadas que cubren un rango dinámico más amplio. ENRICH-iST mostró una mayor precisión en el rango de abundancia medido en comparación con el flujo de trabajo de agotamiento.

La Dra. Catherine Nury, Gerente de Proteómica, Philip Morris International, Suiza, comenta: "Probamos varias opciones para el descubrimiento de biomarcadores en muestras de plasma, pero muchas fueron largas y tediosas. Con la novedosa tecnología ENRICH, tenemos una solución rápida, eficiente y confiable". flujo de trabajo de enriquecimiento para profundizar en el proteoma del plasma y el suero humanos. Usamos los kits ENRICH-iST 96x y estamos encantados con la reproducibilidad y la facilidad del kit. Realmente disfrutamos trabajar con el equipo de PreOmics, que siempre está ahí para apoyarnos. Recomendamos enfáticamente el kit a otros usuarios de proteómica de plasma y suero".

La automatización es clave para la proteómica de plasma de alto rendimiento y Luca Valeggia, vicepresidente sénior de automatización de laboratorio en Tecan, agrega: "Estamos encantados de continuar nuestra colaboración con PreOmics. Al automatizar su nuevo kit ENRICH-iST en nuestra estación de trabajo Fluent, están permitiendo una preparación de muestras de alto rendimiento robusta y reproducible para estudios de cohortes grandes, lo que ayuda a acelerar aún más el progreso en este campo que avanza rápidamente".