Automatización de la tinción en cada banco para una mejor y más reproducible imagen de tejido
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Automatización de la tinción en cada banco para una mejor y más reproducible imagen de tejido

Apr 22, 2023

Parhelia Omni-Stainer™ automatiza los protocolos de biología espacial mientras reduce los costos de los reactivos

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El microambiente tumoral es un conjunto complejo de células cancerosas, células inmunitarias, células del estroma y componentes de la matriz extracelular. Las interacciones entre estos componentes pueden afectar significativamente el crecimiento del tumor y la respuesta al tratamiento. Cierto avance en nuestra capacidad para mapear microambientes tumorales se produjo con el advenimiento de la era de la biología espacial, en la que ahora se utilizan varias técnicas de imagen altamente multiplexadas para mapear docenas de tipos de células in situ y algoritmos computacionales sofisticados para modelar cuantitativamente sus relaciones en el tumor. contexto. Estos protocolos de múltiples pasos son muy costosos, están sujetos a severas limitaciones de rendimiento de muestras, son propensos a la variación del ensayo y son difíciles de adoptar y estandarizar en múltiples laboratorios.

La visión de Parhelia es marcar el comienzo de una nueva era de biología reproducible en la que el cumplimiento, la reproducibilidad y la solidez de la investigación se logran mediante la implementación de la automatización responsable a nivel de un banco individual. En esta visión, los protocolos se compartirán entre los laboratorios no a través de la capacitación individual y la minuciosa ingeniería inversa de prueba y error, sino compartiendo scripts de automatización de código abierto descargables que se pueden implementar con solo presionar un botón. Obligar a los investigadores a traducir el conocimiento a menudo implícito de los detalles esenciales de los protocolos complejos en comandos robóticos exactos y explícitos permitirá una rápida difusión, fácil adopción, control de versiones y validación independiente de nuevos protocolos por parte de la comunidad de pares.

Para ayudar a generar este futuro y abordar los crecientes desafíos en la investigación de la biología espacial, Parhelia Biosciences creó Omni-Stainer™, una estación de trabajo de tinción de tejidos que cambia el juego, capaz de implementar sin problemas una plétora de ensayos espaciales. A diferencia de los voluminosos teñidores automáticos de histología del pasado, Parhelia Omni-Stainer™ es un dispositivo compacto de sobremesa cuyo precio intencionalmente se encuentra dentro de los límites presupuestarios de CapEx de los laboratorios de investigación de tamaño mediano (<$15k).

Parhelia Omni-Stainer es un instrumento modular construido sobre un chasis de un controlador de líquidos de formato SBS de código abierto. Los módulos están diseñados para adaptarse a varios formatos de tinción de tejidos, incluidas muestras regulares montadas en portaobjetos, así como muestras más exóticas montadas en cubreobjetos que se utilizan cada vez más en ensayos espaciales como CODEX o smRNA-FISH.

Cada módulo aloja hasta 12 muestras en paralelo y el Omni-Stainer puede equiparse con hasta 10 de estos módulos, lo que permite un rendimiento máximo de 120 muestras por ejecución. Los módulos Omni-Stainer se pueden equipar con bloques Peltier controlados mediante programación, lo que permite un control preciso de la temperatura en el rango de 0 a 99 °C. Esto permite implementar ensayos con control de temperatura en Parhelia Omni-Stainer, incluidos protocolos ISH, ligadura y amplificación de ADN, IF cíclica y ensayos TSA como Opal.

La tinción de muestras eficiente y uniforme se logra a través del intercambio de espacios capilares, que es la característica clave de Omni-Stainer. Las muestras se incuban en una fina capa capilar de líquido de 60 um, lo que reduce drásticamente el uso de reactivos costosos, como conjugados de ADN-anticuerpo o sondas FISH.

La flexibilidad inigualable de Parhelia Omni-Stainer permite la creación de protocolos complejos arbitrarios a través de una API de Python simple. Además, Parhelia brinda a sus usuarios acceso a StainWorks, una poderosa aplicación web que contiene un repositorio compartido de protocolos validados y permite a los usuarios modificar y ejecutar esos protocolos sin tener que tocar ningún código. Actualmente, StainWorks contiene protocolos validados para IF, IHC, CODEX (PhenoCycler), IMC, Opal y RNAScope, y la lista se expande constantemente.

Parhelia Omni-Stainer ya se ha implementado en instituciones de investigación líderes, como Stanford, Harvard, Broad, MD Anderson, Mayo Clinic, WUSTL, así como en I+D farmacéutica, como Novartis y Genentech.

En resumen, Parhelia Omni-Stainer es una herramienta poderosa para los investigadores de biología espacial, que los libera de las rutinas de tinción de tejidos repetitivas, reduce el uso costoso de reactivos y brinda una calidad y reproducibilidad inigualables de la tinción de tejidos con solo presionar un botón.

Para obtener más información, visite www.parheliabio.com